Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv2Q9WTR1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms