Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcm1Q9R0L6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms