Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms