Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gpc6Q9R087 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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