Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms