Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms