Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxe3Q9QY14 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms