Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mid2Q9QUS6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms