Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Higd1aQ9JLR9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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