Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms