Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod4Q9JLH8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod4Q9JLH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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