Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms