Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms