Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms