Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppp2r3cQ9JK24 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms