Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms