Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms