Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkc1Q9ESX5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms