Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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