Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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