Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf6Q9DBU5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf6Q9DBU5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf6Q9DBU5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf6Q9DBU5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf6Q9DBU5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf6Q9DBU5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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