Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms