Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5oQ9DB20 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms