Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms