Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms