Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl17Q9D8P4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms