Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Capns2Q9D7J7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Capns2Q9D7J7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms