Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms