Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms