Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms