Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gm3404Q9D506 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm3404Q9D506 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3404Q9D506 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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