Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms