Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
4933428G20RikQ9D3X4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms