Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms