Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms