Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps28Q9D1C8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms