Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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