Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms