Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mis12Q9CY25 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms