Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkrip1Q9CWV6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms