Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms