Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot11Q9CWN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot11Q9CWN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms