Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a2Q9CTG6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms