Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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