Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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