Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms