Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms