Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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