Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RtcbQ99LF4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RtcbQ99LF4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms