Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms